O Departamento de Engenharia Florestal (DEF) está organizado em quatro secções académicas (Figura 6): Secção de Silvicultura, chefiada pela Doutora Faura Cangy, Eng.; Secção de Ciência e Tecnologia da Madeira, chefiada pela Eng. Eunice Catarina Sitoe Remane; Secção de Economia e Maneio Florestal, chefiada interinamente pelo Doutor Jaime Macuácua, Eng.; e Secção de Exploração e Transporte da Madeira, chefiada pelo Mestre Jaime Nhamire, Eng. Cada secção dispõe de laboratórios especializados: o Laboratório de Silvicultura na Secção de Silvicultura; os Laboratórios de Estrutura e Propriedades da Madeira na Secção de Ciência e Tecnologia da Madeira; o Laboratório de Teledetecção na Secção de Economia e Maneio Florestal; e o Laboratório de Exploração Florestal na Secção de Exploração e Transporte da Madeira. O DEF desenvolve actividades de ensino, investigação aplicada e extensão universitária, contribuindo para a formação de profissionais especializados em silvicultura, tecnologia e processamento de madeira, gestão florestal e exploração sustentável dos recursos florestais.

Estrutura orgânica do Departamento de Engenharia Florestal